cleanUrl: "how-to-use-sciclone"
description: "종양 내 이질성 분석 도구인 SciClone의 사용법을 알아봅니다."

설치

Bioconductor에서 IRanges를 받고, devtools를 이용해서 설치해준다. 나는 Anaconda R 배포판을 쓰고 있기 때문에, IRanges 와 devtools 모두 conda로 설치 가능하다. ggplot2도 필요하다. 따로 설치해주자.

conda install -y bioconductor-iranges
conda install -y -c r r-devtools
conda install -y -c conda-forge r-rlang

다음으로 R에서 bmm과 sciClone을 설치한다. 좀 걸린다.

library(devtools)
install_github("genome/bmm")
install_github("genome/sciClone")